El convenio de la CEPE pretende reforzar las medidas nacionales para la protección y la gestión ecológicamente sostenible de las aguas transfronterizas, tanto superficiales como subterráneas. El convenio obliga a las Partes a prevenir, controlar y reducir la contaminación del agua desde las fuentes, tanto fijas como dispersas, e incluye medidas para el seguimiento, la investigación y el desarrollo, las consultas, el sistemas de alerta y de alarma, la asistencia mutua, los acuerdos institucionales, y el intercambio y protección de información, así como el acceso público a la información.