Este estudio presenta una metodología para la evaluación de vulnerabilidad de un acuífero superficial, no confinado, ubicado en la zona baja de la cuenca del río Chillán. La metodología está basada en el uso de índices desarrollados usando una combinación lineal de las variables que gobiernan el proceso de recarga y transporte de contaminantes en un sistema de aguas subterráneas y considerando a la disponibilidad de datos de la zona en estudio. Los resultados se presentan a la forma de cartas temáticas mediante un sistema de información geográfica (SIG), permitiendo identificar áreas de mayor o menor susceptibilidad a la contaminación. También se identificaron las áreas con mayor riesgo de contaminación de origen agropecuaria. Se contrastaron los resultados obtenidos con valores de concentración de nitratos medidos en norias y se determinó que existe una relación significativa entre los valores de índice calculados y los valores de concentración medidos.