La vulnerabilidad de acuífero frente a un foco de contaminación areal como es el uso de aguas residuales y lodos en agricultura, puede ser muy alta sobre todo si las características de la zona no saturada no son las idóneas para que los contaminantes presentes en estas aguas y lodos sufran procesos que den lugar a una disminución de su presencia. Un ejemplo del efecto contaminante por reuso de aguas residuales en riego es lo ocurrido en el acuífero del Valle de León (México), el cual ha sufrido un deterioro de la calidad de sus aguas por presencia de algunos de los contaminantes que están presentes en el agua residual. En otros casos, la zona no saturada actúa como barrera frente a una contaminación originada, por ejemplo, por el uso de lodos en agricultura. Este hecho se ha podido comprobar en una parcela experimental, localizada en el acuífero del Valle de Toluca (México), en la cual se ha estudiado el comportamiento del nitrógeno y fósforo.